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Premier laboratoire de recherches créé en 1901 en France pour lutter contre les maladies infectieuses animales, le laboratoire d'études et de recherches en pathologie animale et zoonoses est situé à Maisons-Alfort. Il réunit 120 personnes et est lié au campus de l'Ecole nationale vétérinaire d'Alfort.

Ses travaux l'amènent à exercer une forte activité d'appui scientifique et technique. Ils sont centrés autour de deux pôles: une importante activité de référence et d'expertise (4 EILA, et plus de 30 000 analyses par an), associée à une activité de recherche de qualité menée en collaboration avec d'autres organismes et labellisée par le ministère de la recherche (Unité mixte de recherche).
Les travaux du laboratoire sont concentrés sur la maîtrise (i) des grandes épizooties (fièvre aphteuse, fièvre catarrhale ovine…), (ii) des zoonoses bactériennes, virales et parasitaires, et (iii) des maladies infectieuses animales émergentes pluri-espèces et notamment des maladies vectorielles et des mycoses opportunistes.

Le laboratoire s'appuie sur l'ensemble de ses compétences pour fournir une aide à la décision aux autorités sanitaires:
- il développe des outils de détection et de caractérisation des agents pathogènes animaux des espèces domestiques ou sauvages plus rapides et fiables (diagnostic par PCR quantitative) ainsi que de nouvelles méthodes de typage (Variable Number Tandem Repeats- VNTR,....).
- il analyse les relations hôtes-agents pathogènes afin de mettre en place de nouvelles stratégies de prévention des maladies animales (vaccins).
- il surveille l'apparition des épizooties dont il a la charge afin d'en prévenir la diffusion et analyse leurs causes. Il contribue ainsi à l'évaluation des risques qui leur sont associés et est, notamment en charge des alertes « fièvre aphteuse et maladies vésiculeuses apparentées ».
- Laboratoire de référence pour la plupart de maladies animales épizootiques/zoonotiques pluri-espèces au niveau national, européen ou mondial, il apporte un soutien scientifique et technique pour le contrôle sanitaire de ces maladies.

Unités et équipes de recherche

- Zoonoses bactériennes
- Épidémiologie
- Virologie (unité mixte de recherche Afssa-Inra-Enva)
- Biologie moléculaire et immunologie parasitaires et fongiques (unité mixte de recherche Afssa-Inra-Enva-Université Paris XII)

Action concernant la recherche opérationnelle

Le nombre d'analyses est en augmentation sensible par rapport à 2007, augmentation en partie liée à l'épidémie de FCO, l'émergence du parasite Alaria alata et de nombreux échantillons reçus en Unité zoonose bactérienne.
De même le nombre d'EILA organisé est en croissance avec un EILA FCO supplémentaire en 2008. Le nombre de laboratoires encadrés reflète l'impact du laboratoire d'études et de recherches en pathologie animale et zoonoses au niveau référence Santé animale.

Action concernant la recherche appliquée

Le laboratoire d'études et de recherches en pathologie animale et zoonoses a eu 50 publications de rang A pour l'année 2008 et une participation à une vingtaine de congrès internationaux et de nombreuses conférences invitées. Plus de 50 communications orales ou affichées ont été réalisées. Une moyenne de 2 publications par an par chercheur/ingénieur est donc obtenue à nouveau cette année. De nombreuses publications dans des revues professionnelles (30) ainsi que des chapitres d'ouvrage ont été réalisées.

Formation

Elle se réalise au niveau national et international: pas moins de 14 stages ont été organisés en France en 2008 conduisant à la formation professionnelle de 51 stagiaires;
La formation doctorale est très soutenue avec l'accueil de masters 2 et de doctorants (plus de 10) montrant l'intégration universitaire des unités mixtes et l'effort de développement des unités propres et des nouvelles unités soutenues en commun.
Les jours dispensés en formation à l'extérieur sont importants en nombre et reflètent la présence d'enseignants-chercheurs de l'Ecole nationale vétérinaire d'Alfort et de l'Université Paris XII dans l'effectif du laboratoire.

Contractualisation

Les conventions sont au nombre de 41, soit un peu moins de 2 par scientifique. L'addition des conventions obtenues à travers les unités mixtes de recherche permet d'obtenir un nombre total proche de 60. L'impact de ces conventions est très inégal et concerne l'Agence nationale de la recherche, l'Europe (Specific Targeted Research Projects - STREP, European Cooperation in Science and Technology-COST, Marie Curie), des contrats bilatéraux, des bourses ou contrats régionaux (Domaines d'intérêts majeurs). La convention du LCR pathologie équine mise en place en 2008 est certainement la plus structurante de toute. Cette convention est partagée avec le Laboratoire d'études et de recherches en pathologie équine.

Aout 2009

Principaux partenaires

- France: Partenaires institutionnels
Laboratoires Afssa, OIE, ministère de l'Agriculture et de la Pêche (Direction générale de l'alimentation), InVS, Inra, Cirad, Centre national d'études spatiales, Écoles nationales vétérinaires, Institut Pasteur de Paris, Association pour la certification de la santé animale, Fédérations nationales de groupement de défense sanitaire, Office national de la chasse et de la faune sauvage, Centre d'études du Bouchet, Hôpital interarmées Begin, Centre de recherches des services de santé des armées, Laboratoire central de la préfecture de police, Université Paris-Sud-Orsay, Université Paris XII, Université Paris VI, Conseil régional d'Île-de-France…

- France: Partenaires privés
MERIAL, SEPPIC, ID-VET, Institut Pourquier, Bio-Rad, Microvision.

- À l'international
Université d'Agriculture de Lanzhou (Chine), Université de Jilin (Chine), Université du Guangzi (Chine), Centre de recherches et d'études avancées de l'Institut polytechnique national (Cinvestav, Mexique), Centre de recherche en technologie agroalimentaire (CITA, Espagne), Centre belge d'étude et de recherches vétérinaires et agrochimiques - CODA-CERVA (Belgique), Université de l'Arizona (Flagstaff, USA), Université de Davis (USA), Université de Zagreb (Croatie), tous les laboratoires nationaux de référence européens, the European Commission for the control of Foot-and-Mouth disease (EuFMD), groupe de recherche du comité européen de lutte contre la fièvre aphteuse de la FAO (Rome), de très nombreux instituts de recherche européens (tous les pays de l'Union européenne sont représentés).