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Les contaminants sont des molécules naturelles ou issues de la chimie qui se retrouvent dans les aliments. Ils peuvent être issus des pesticides employés dans l'agriculture, ou originaires de pollutions diverses. Il existe également des contaminants d'origine naturelle, comme des toxines, produites par des bactéries ou des virus des moisissures.

L'Afssa est chargée d'évaluer les doses maximales de résidus qui sont sans danger pour la santé.
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