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Depuis 2006, plusieurs épizooties de fièvre catarrhale ovine ont touché la France et l'Europe. Certaines d'entre elles se sont avérées liées à l'introduction de nouveaux sérotypes (de Blue tongue virus, BTV) dans les pays concernés. En octobre 2008, face à cette situation, l'Afssa a été saisie d'une demande de la Direction générale de l'alimentation d'estimation du risque d'introduction de nouveaux sérotypes en France. Dans le cas d'un risque probable, l'Agence devait émettre des recommandations en matière d'épidémiosurveillance et de prévention.
Les experts de l'Afssa ont formulé plusieurs conclusions. Ainsi, l'Afssa souligne la nécessité de mettre en place un système d'informations en temps réel de la distribution européenne, des foyers de FCO. Par ailleurs, pour l'année 2009, elle estime non négligeable la probabilité d'introduction d'un sérotype - exotique ou non - sur le territoire métropolitain. De ce fait, l'Agence recommande d'assurer la continuité des mesures de surveillance passive en vigueur en France. Enfin, dans l'hypothèse de l'introduction d'un sérotype exotique, et sous certaines conditions, l'Agence préconise l'abattage des animaux infectés et la recherche des facteurs liés à l'introduction du nouveau sérotype et à sa diffusion. Enfin, pour prévenir le développement d'une épizootie due à l'introduction (prévisible ou accidentelle) d'un nouveau sérotype en France, elle recommande la vaccination d'urgence des troupeaux non atteints.
Pour rappel, à la suite de l'introduction du sérotype 8, en 2006, puis à celle du sérotype 1, en 2007, la France a été confrontée à deux vagues épizootiques sans précédent de fièvre catarrhale ovine. Actuellement, sept sérotypes de FCO circulent (ou ont circulé) en Europe et, pour certains d'entre eux, dans d'autres régions du pourtour méditerranéen. En octobre 2008, l'introduction aux Pays-Bas d'un nouveau sérotype (sérotype 6) a été observée. Elle n'a donné lieu qu'à une circulation virale limitée (une quarantaine de foyers au total dans ce pays et en Allemagne). Début mars 2009, grâce aux enquêtes réalisées et à la situation épidémiologique, la levée des mesures de contrôle mises en place pour ce sérotype a été décidée. La présence de ce sérotype serait liée à l'utilisation de vaccins multivalents contenant le sérotype 6. En effet, les études phylogénétiques ont indiqué une forte proximité génétique de cette souche avec une souche d'origine vaccinale.
Plus récemment, en février 2009, en Belgique, l'émergence d'un nouveau sérotype (BTV 11) a été notifiée sur un bovin isolé, puis sept exploitations belges touchées ont été recensées. Début mars 2009, l'absence d'évolution de la situation (absence de diffusion de ce sérotype) a permis une levée des mesures de contrôle établies. Autres phénomènes observés, d'autres sérotypes de BTV circulant en Turquie, en Israël (le BTV 15 et récemment le BTV 24) et au Maghreb et, en 2008, la mise en évidence d'un nouvel orbivirus (BTV 25) chez des chèvres en Suisse.
Dernièrement, au 5 mars 2009, en France, pays européen officiellement le plus touché par la FCO en 2008, un total de 32 321 foyers de FCO de sérotypes 1 et 8 (tous confondus) ont été enregistrés. La période d'inactivité vectorielle s'est étendue officiellement du 5 janvier 2009 au 11 mars 2009. La reprise de l'activité vectorielle en date du 12 mars 2009 signe la remise en vigueur des mesures de surveillance sentinelle et de désinsectisation, ainsi que la clôture des foyers identifiés au titre de 2008. Pour l'année 2009, la police sanitaire de la FCO prévoit une prophylaxie médicale obligatoire sur l'ensemble du territoire pour les sérotypes 8 et 1. La campagne de vaccination a débuté le 15 décembre 2008 et devrait prendre fin le 30 avril 2009.
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