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L'huile de lin présente un intérêt nutritionnel du fait de sa richesse en acide alpha-linolénique, le précurseur des acides gras de la famille oméga-3. Pour autant, cette huile présente un inconvénient majeur: sa capacité d'auto-oxydation, phénomène chimique qui altère sa stabilité et, de ce fait, ses qualités nutritionnelles et sensorielles.
Bien que couramment utilisée dans les pays de l'Union européenne, elle n'est toujours pas commercialisée dans notre pays. En 2006, l'Afssa donnait un avis favorable pour son utilisation à froid (assaisonnement) et en mélange avec d'autres huiles et recommandait une évaluation préalable à l'utilisation de l'huile de lin vierge, afin de s'assurer des conditions de stabilité. Dans un second avis rendu en mars 2009, l'Agence considère que la commercialisation de l'huile de lin vierge doit être assortie de conditions de fabrication, de conservation et de consommation connues, cela afin de maîtriser les risques sanitaires liés à l'oxydation du produit. Ces conditions concernent, notamment, la traçabilité des lots d'huile; le conditionnement (en matériau opaque et limité à 250 ml), la durée d'utilisation (limitée à 9 mois) et les conditions d'utilisation à froid. Enfin, l'Afssa recommande d'informer le consommateur par des mentions d'étiquetage, telles que: "réserver à l'assaisonnement; ne pas chauffer; conserver à l'abri de la chaleur avant ouverture; conserver au réfrigérateur après ouverture". S'agissant des enfants, en l'absence d'études sur l'intérêt nutritionnel et l'innocuité de la consommation de l'huile de lin dans cette tranche d'âge, l'Agence réitère ses précédentes recommandations, à savoir: ne pas utiliser l'huile de lin dans l'alimentation des enfants de moins de 3 ans et prévoir une mention d'étiquetage sur ce point.
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