La recherche à l'Anses concerne la santé animale, le bien-être animal, la sécurité des aliments et le comportement alimentaire.
Elle est finalisée, opérationnelle et indépendante de tout intérêt commercial. Elle vient alimenter l'appui scientifique et technique et l'évaluation des risques. Elle est réactive, mobilisée sur l'anticipation et l'alerte. Elle est régulièrement évaluée. Elle associe les meilleures équipes scientifiques françaises et étrangères. Elle est tête de réseau au niveau international (Med-Vet-Net).
De ce positionnement exigeant et unique dépendent la protection du consommateur et l'intérêt bien compris du secteur économique lui-même.
Les activités de référence concernent les domaines des maladies animales et de la qualité des aliments.
Conduites au sein des laboratoires de l'Anses, elles s'exercent sous différents mandats au niveau national, européen ou international.
L'activité de référence est essentielle au dispositif sophistiqué de surveillance sanitaire. Afin de mieux partager, et par là même valoriser, les activités de référence, l'Agence a initié la publication d'un journal électronique intitulé les «EuroReference».
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Listes des publications scientifiques 
